8月13日早间，香港机场管理局官网发布消息，13日香港国际机场将实施航班重新编配，航班升降将会受到影响。据飞常准统计，截至8月13日10：00，香港机场已取消进出港航班322架次，占比28.27%。
8月12日，示威者在香港国际机场集会，香港机场管理局启动机场紧急事故应变中心，并于当日下午4点宣布：除已经完成登记程序的离港航班及正在前往香港的抵港航班以外，其余12日当天的所有航班全部取消，所有登机服务也随即暂停。
12日当天，香港国际机场共取消航班238架次。包括国航南航东航在内的境内多家航空公司相继发布了处置措施，乘客可在适用规则的情况下免费退改签。
中国东方航空
东航发布出行提示，取消8月12日-13日期间部分香港进出港航班，后续东航将根据香港国际机场运行保障情况，动态调整航班。
图片来自东航官方微博
东航的客票改退措施适用日期为：出票日期为2019年08月12日（含）前，原旅行日期为2019年08月12日-2019年08月13日的客票。
原客票航程为东航和上航涉及香港航线的781票证开具的客票（包括东航实际承运航班和*MU代码共享航班）均适用于该政策。
东航方面表示，在客票有效期内可免费更改至2019年08月20日（含）前东航实际执飞的香港、广州、深圳、珠海、澳门进出港的东航上航实际承运航班。乘客也可以免费在客票有效期内至原购票渠道退票。
中国南方航空
12日，南方航空也发布了《关于香港航线相关机票特殊处理的通知》。
南航官方微博
对于出票日期为2019年8月12日（含）前，旅行日期为2019年8月12日（含）至2019年8月18日（含），航程包含中国内地与香港之间南航航段的，客票未使用部分免退票费退票（包括原客票规则不允许退票的客票）。
或者免费变更一次至8月25日（含）前的南航实际承运的香港、广州、深圳、珠海进出港航班，允许变更航程，不收取票价和税费差额。变更至8月26日(含)后的航班，按照自愿变更处理。
中国国际航空
针对香港国际机场全面停止运作的情况，国航13日就涉及中国香港航线客票处置方案发布通知。
图片来自国航官方微博
通知称，在2019年8月12日（含）前购买的，涉及国航中国香港航线（包括国航实际承运航班和挂CA航班号的代码共享航班），且旅行日期为2019年8月12日至8月13日期间及8月14日CA118航班的999客票（包括里程奖励客票）均在变更及退票适用范围内。
在客票有效期内，国航将免费为首次提出航班变更申请的旅客更改至2019年8月19日(含)前中国香港、广州、深圳、珠海、中国澳门航线进出港的国航实际承运航班。
同时，国航称，将增加8月13日北京－深圳航线的运力投入，后续将根据香港国际机场运行情况，动态调整航班。
春秋航空&吉祥航空
12日晚间，吉祥航空和春秋航空两家廉航也发布了关于中国香港地区航线客票特殊退改方案。
吉祥航空表示，旅客可更改一个月内上海浦东到香港的航班无需手续费，客票有效期内办理退票也无需支付手续费。
图片来自吉祥航空官方微博
春秋航空表示，凡在2019年8月12日（含）之前购买，旅行日期为2019年8月12日（含）到2019年8月18日（含），已预订春秋航空承运的中国内地与香港地区航班的客票，如申请办理退票手续，免退票手续费。
图片来自春秋航空官方微博
客票有效期内，可免费变更一次至2019年8月25日（含）之前春秋航空实际承运的香港、澳门、广州、深圳、珠海、揭阳进出港航班，免手续费；变更至8月26日(含)之后的航班，按照自愿变更处理。
四川航空&深圳航空
四川航空和深圳航空也发布了香港航线机票免费变更、退票政策。
图片来自深圳航空官方微博
川航的退改签政策适用于2019年8月12日（含）之前出票，由川航876票证填开的所有涉及香港进出港航班的客票。以及2019年8月12日（含）-8月18日（含）的航班。
图片来自四川航空官方微博
川航表示，允许对符合上述规定且在有效期内的未使用航段客票免费变更至8月25日（含）之前的航班或办理自愿退票，免收退票手续费（包括原客票规则不允许退票的客票）；2019年8月12日（含）之前已提出改期、退票的客票按自愿规则办理。
